不管油墨是由油墨供货商或自行调配，都不能准确地把油墨的颜色调配出来，即使可以成功把颜色调配出来，亦要赔上很多时间，及浪费大量油墨。虽然有业界会使用计算机配色系统协助调配凹版油墨，固然时间上的确可以节省很多，但他们仍然觉得准确性不足。其实凹版油墨配色与平版油墨配色比较，凹版油墨的配色工序是来得复杂及困难的，因为影响凹版油墨颜色的变量多不胜数。

提及影响凹版油墨颜色的变量，网目滚筒上的网目细度会影响颜色，答案基本上是正确但并不完全。原则上，网目细度的确影响颜色，但一般凹版印刷技术员都会考虑到这个问题。其实除了网目细度外，另一个被人遗忘的因素亦经常被忽略。在凹版印刷时，油墨黏度往往被印刷技术员忽略，在调配配方时，黏度更被严重忽视。即使油墨供货商及印刷厂均会因黏度的影响以致油墨颜色出错。

除了凹版油墨的黏度外，印刷厂会忽略套白的问题。尤其在塑料包装印刷上，由于凹版油墨印刷在塑料薄膜上，其颜色往往是透明的，所以颜色较容易受背景影响。因此在印刷过程中，经常会在印有颜色的油墨上再加印一层白色油墨作底，亦即套白，主要原因是增加整体油墨的遮盖力，使颜色不透明及在同一状态下呈现，以免除因背景颜色所造成的颜色偏差。该层白色油墨已经会影响整体颜色，情况就好像平版印刷时，纸张的颜色会影响印刷品的颜色及其油墨配方，即用作套白的白墨仿如白纸，因此在配色前必须清楚明白套白的白墨的颜色，以便调节配方。

更要注意印刷机速度、油墨黏度、网目细度及托白等环境条件，不仅在使用计算机配色要考虑，即使是人工配色亦要同样考虑到，因此人工调配凹版油墨颜色配方是十分困难的。人工调配时，经常会出现颜色可以调配出来，但黏度未能控制至配合印刷机速度，最后加入溶剂调节黏度，反而使印刷颜色偏淡。因此只要计算机配色系统可以预先把油墨黏度、网目细度及托白等相关的环境条件输入计算机，计算机便可以计算出合适的配方。这配方不但可以因应不同网目细度及印刷机速度配制准确的颜色，而且可以控制油墨黏度。